Unilateral cross-feeding constrains adaptive evolution, even in the producer without direct fitness effects.
片方向の栄養供給（クロスフィーディング）相互作用は、直接的な適応度の利益が一方にしか存在しない場合でも、微生物群集における両種の適応進化を制限し、純粋培養に比べて自然選択の圧力を強めることが示された。
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evolutionary biology
458 件の論文
Estimating Bayesian phylogenetic information content using geodesic distances
この論文は、事前分布と事後分布からサンプリングされた系統樹の相分散比に基づき、地測距離を用いて系統樹空間におけるベイズ的系統情報量を推定する新たな手法を提案し、その有効性をシミュレーションおよび実データで示したものである。
Endosymbiotic algal photosynthesis shapes diel transcriptome architecture in its ciliate host Paramecium bursaria
光合成を行う共生藻が、宿主である繊毛虫パラメシウム・ブルサリアの日内転写プログラムを再編成し、そのリズムを支配する主要な組織者として機能していることが、光合成阻害実験や近縁種の比較を通じて明らかになった。
Bridgehead invasions of ambrosia beetles are structured by inbreeding and hybridisation
この研究は、世界中に侵入したコナラキクイムシの複合体において、橋頭堡からの侵入が遺伝的負荷を蓄積させる一方で、異なる系統間の交雑が有害変異の除去を助ける可能性を示し、特に南アフリカで見られる遺伝的多様性が低い単一系統と、それと交雑した第二系統の遺伝的パターンを解明したものである。
Population genomics reveal genetic variants associated with lunar-regulated spawning time in grass puffer
本論文は、イボイワシの日本沿岸における月齢に同期した産卵時刻の地理的変異が、自由走行リズム周期（τ）の差と、その周期を調節する候補遺伝子 prrt1l の変異によって説明されることを、集団ゲノム解析と機能検証を通じて明らかにしたものである。
Limited genetic structure and high gene flow in Fasciola hepatica populations infecting ruminants in different geographic areas in the UK
この研究では、イギリスの異なる地域で反芻動物を感染させる Fasciola hepatica（肝吸虫）の集団において、家畜の移動や寄生虫の適応によって促進される高い遺伝子流動が確認され、地理的な構造が限定的であることが、高スループットシーケンシングを用いた解析から明らかになりました。
Entangled adaptive landscapes facilitate the evolution of gene regulation by exaptation
本研究は、大腸菌の転写因子結合部位が、個々の適応的な変異を積み重ねることで滑らかな適応度地形を介して別の転写因子の結合部位へと進化する（前適応する）ことを実証し、その過程で生じる転写クロストークが遺伝子制御の多様化に重要であることを示しました。
Beyond Fixation: Persistent Genetic Variation Under Intense Selection
本論文は、ショウジョウバエを用いた長期実験進化研究を通じて、強い方向性選択下でも多型が維持され、選択圧の逆転時に迅速に再発現する現象が広範な平衡選択によるものであることを示しました。
No genetic evidence yet for hinnies at Mazongshan (400-160 BCE), northwestern China
中国北西部の馬宗山遺跡（紀元前 400 年〜紀元前 160 年）から報告されたヒンニー（雄ロバと雌ウマの雑種）の遺伝的証拠は、再解析により実際にはロバであったことが判明し、同遺跡におけるヒンニーの存在を示す決定的な証拠は現時点では存在しないことが示されました。
The colourless dictyochophyte Ciliophrys sp. Baltic secondarily lacks a plastid but hosts a bacterial endosymbiont
この研究は、二次的に葉緑体を喪失した有色のダイクティオコフィア類（Ciliophrys sp. Baltic）が、宿主の代謝欠損を補うために細菌内共生体（Candidatus Penulousia baltica）を保持していることをゲノムおよびトランスクリプトーム解析により明らかにし、葉緑体喪失と内共生獲得の新たなモデル系を確立したものである。
The geometry of dominance shows broad potential for stable polymorphism under antagonistic pleiotropy
この論文は、従来の理論が「優性の反転」や「強い選択」を必須条件としていたのに対し、幾何学的解析によって拮抗的多面性における平衡多型維持の条件は実際には非常に広く、優性の反転を必要としないことを示しています。
Sub-cellular Systems Drift Drives Mosaic Evolution of Mammalian Neurons.
マウスとラットの単一ニューロンにおける樹状突起と細胞体の転写産物を比較した本研究は、樹状突起の転写プロファイルが細胞体よりも進化的に多様化している一方でその機能的役割は保存されていることを明らかにし、シナプス機能レベルでのモザイク進化とシステムドリフトの存在を提唱しています。
Regional connectivity and viability selection in a range-expanding marine species
本研究は、実験的トランスクリプトミクスを用いて開発した遺伝子パネルにより、ケレット巻貝の分布拡大域において自己再定着率が低く、定着後の選択的フィルターが生存率の差を生み出していることを明らかにしました。
Purifying selection and phylogenetic discord among microneme proteins in Toxoplasma gondii
トキソプラズマの微小器タンパク質（MIC13、MIC12、MIC16）は、宿主 - 寄生体界面での適応的多様化という従来の予想に反して、正の選択ではなく強い純化選択と遺伝子間の系統的不一致によって進化していることが、比較解析により明らかになりました。
Somatic Programmed DNA Elimination is widespread in free-living Rhabditidae nematodes
本研究は、モデル生物である C. elegans を除く自由生活性線虫 Rhabditidae 科の広範な種において、体細胞核でのプログラムされた DNA 排除が普遍的に存在することを細胞学的に実証し、この現象のメカニズム解明に向けた新たな実験系を提供したものである。
Phylogenomics and Fossilized Birth-Death Dating Reveals Extensive Post-Cretaceous Worldwide Diversification of Cicadidae (Hemiptera, Auchenorrhyncha)
本研究は、490 の核遺伝子座とミトコンドリアゲノム、ならびに 44 の化石種を用いた系統ゲノム解析と化石出生死モデルに基づく分岐年代推定により、セミ科が白亜紀に起源を持ち、K-Pg 大量絶滅直後に世界的に多様化したことを明らかにし、従来の節点較正法よりも精度の高い年代推定を提供した。
Linking genotype to longevity under genealogical discordance in Sebastes rockfishes
この論文は、系統樹の不一致が極めて高いスズキ属（Sebastes）において、系統的不一致を考慮した phyloGWAS 手法を用いることで、遺伝子型と長寿という表現型の関連を特定できることを示しています。
Charting the landscape of organellar genome evolution in eustigmatophyte algae
本研究は、51 の新規オルガネラゲノムを追加してユスティグマトフyce 藻類の系統関係を解明し、その葉緑体ゲノムの安定性とミトコンドリアゲノムの多様性を比較するとともに、種特異的とされていた遺伝子の起源や新規オルソグループの存在、そして翻訳機能以外の tRNA の役割など、オルガネラゲノム進化の重要な知見を提供しました。
RNA-ligand complexes and the attenuation of neutral confinement in the evolution of RNA secondary structures
リガンドとの結合による高安定構造の隔離と熱揺らぎによる再供給というメカニズムが、RNA 進化における中立閉塞を回避し、構造的多様性を維持する鍵であることが、RNA-リガンド複合体の進化シミュレーションにより示唆された。
Impacts of genome architecture on the repeatability of polygenic adaptation
ゲノム構造（染色体数）と遺伝子間相互作用（エピスタシス）が、多遺伝子適応のダイナミクスと予測可能性を決定づけることが、染色体数と塩分適応能力が異なるコペポダの進化実験およびシミュレーションから示された。